Natsume, é uma criança como outra qualquer, exceto que pode ver espíritos, assim como sua avó Reiko. Mas, Reiko, costaumava maltratar os espíritos, e os aprisionando de acordo com sua vontade no Livro dos amigos. Agora que Natsume, herdou o livro, uma horda sem fim de espíritos virá atrás dele. Com a ajuda do espírito gato, Natsume, passa seus dias anulando os contratos que aprisionam os espíritos e tentando não ser morto.