A história começa com Sonic tentando salvar Cream e Cheese das garras do Dr. Eggman que ativou o poder do Controle do Caos fazendo com que ele, Sonic e os seus amigos Amy, Knuckles, Tails, Cream e Cheese fossem tele transportados para o planeta Terra onde eles conhecem os humanos Christopher Thorndyke, o seu avô Chuck Thorndyke e os amigos da escola de Chris - Helen, Danny e Francis.